Mikrobiomanalyse – spennende ny teknologi gir merverdi
Mikrobiomet betegner alle mikroorganismer (bakterier og sopp) som finnes i en gitt prøve eller et produkt. Ved hjelp av DNA sekvensering kan vi nå analysere komplekse bakterie- eller soppopulasjoner i f.eks. mat- og miljøprøver. Mikroorganismer kan endre utseende, lukt, tekstur eller farge av en matvare. Med denne metoden kan vi identifisere alle bakteriene i en råvare, miljøprøve eller ferdig produkt ned til artsnivå og dermed gi et unikt innblikk i mikrofloraen som er tilstede i prøven.
Mikrobiomanalyse er:
- Mer informativ enn kulturmetoder, med identifikasjon av bakterier ned til artsnivå
- Spesielt egnet for identifikasjon av arter som er vanskelige å dyrke, fordi metoden er uavhengig av mikrobielle anrikningstrinn
- Metoden kan anvendes direkte på produkt (matvare, ingrediens, avfallsprodukt, etc.), miljøprøver (svaber, klutprøver) eller på kolonier fra agarskål eller petrifilm
Eksempler - bruk av mikrobiomanalyse i næringsmiddelindustrien
Verktøy i problemløsning ved kvalitetsavvik – misfarging av produkt
Foto: IntechOpen
- Funn av Leuconostoc gelidium i områder med gul misfarging
- Tilpasning av rengjørings- og desinfeksjonsprosedyrer
- Tilpasset overvåkingsplan av produksjonsmiljø rettet mot Leuconostoc ssp.
Verktøy i problemløsning ved kvalitetsavvik – utfordring med holdbarhet på spesifikk produktbatch
- Mikrobiomanalyse av «problem-batch» og «referanse-batch» utføres, og resultatene sammenliknes for å finne årsak til svikt i angitt holdbarhet
- Spesifikke bedervelsesbakterier blir identifisert og målrettede korrigerende tiltak kan igangsettes
Kartlegge mikroflora i produkt ved holdbarhetsforsøk
- Mikrobiomanalyse av ferdigvare ved ulike tidsintervaller i et holdbarhetsforsøk gir informasjon om relativt mengdeforhold av mikroorganismer i produktet ved angitt analysetidspunkt
- Ved å analysere mikrobiomet utover i holdbarhetsperioden får man nyttig informasjon om den mikrobiologiske utviklingen i produktet over tid
- Informasjon fra mikrobiom-analysen kan kombineres med klassiske mikrobiologiske dyrkningsmetoder og sensoriske analyser for å angi korrekt holdbarhet av et produkt
Identifisere mikroorganismer som vokser på en agarskål, petrifilm eller miljøsvaber/klut
- Rask identifikasjon av alle mikroorganismer som er tilstede i en blandingskultur på skål, film eller i en miljøprøve uten tidkrevende og kostbar rendyrkning av enkeltisolater
- Mikrobiom-analyse av en miljøprøve kan gi svar på hvilke mikroorganismer som er tilstede i et gitt prøvepunkt i produksjonsmiljøet, også mikroorganismer som ikke er dyrkbare ved standard dyrkningsmetoder, for eksempel visse typer psykrofile mikroorganismer